Detalhe da pesquisa
1.
Pan-cancer analysis of post-translational modifications reveals shared patterns of protein regulation.
Cell
; 186(18): 3945-3967.e26, 2023 08 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37582358
2.
A proteogenomic portrait of lung squamous cell carcinoma.
Cell
; 184(16): 4348-4371.e40, 2021 08 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34358469
3.
Protein Kinase Signaling Networks Driven by Oncogenic Gq/11 in Uveal Melanoma Identified by Phosphoproteomic and Bioinformatic Analyses.
Mol Cell Proteomics
; 22(11): 100649, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37730182
4.
A framework for considering prior information in network-based approaches to omics data analysis.
Proteomics
; 23(21-22): e2200402, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37986684
5.
Newt: a comprehensive web-based tool for viewing, constructing and analyzing biological maps.
Bioinformatics
; 37(10): 1475-1477, 2021 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33010165
6.
A highly multiplexed quantitative phosphosite assay for biology and preclinical studies.
Mol Syst Biol
; 17(9): e10156, 2021 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34569154
7.
Phosphoproteomic quantitation and causal analysis reveal pathways in GPVI/ITAM-mediated platelet activation programs.
Blood
; 136(20): 2346-2358, 2020 11 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32640021
8.
Pathway Commons 2019 Update: integration, analysis and exploration of pathway data.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D489-D497, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31647099
9.
Identification, Quantification, and System Analysis of Protein N-ε Lysine Methylation in Anucleate Blood Platelets.
Proteomics
; 19(11): e1900001, 2019 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30977292
10.
Platelet procoagulant phenotype is modulated by a p38-MK2 axis that regulates RTN4/Nogo proximal to the endoplasmic reticulum: utility of pathway analysis.
Am J Physiol Cell Physiol
; 314(5): C603-C615, 2018 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29412690
11.
PathwayMapper: a collaborative visual web editor for cancer pathways and genomic data.
Bioinformatics
; 33(14): 2238-2240, 2017 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28334343
12.
Assessment of roles for the Rho-specific guanine nucleotide dissociation inhibitor Ly-GDI in platelet function: a spatial systems approach.
Am J Physiol Cell Physiol
; 312(4): C527-C536, 2017 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28148498
13.
PaxtoolsR: pathway analysis in R using Pathway Commons.
Bioinformatics
; 32(8): 1262-4, 2016 04 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26685306
14.
Pattern search in BioPAX models.
Bioinformatics
; 30(1): 139-40, 2014 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24045775
15.
Prediction of individualized therapeutic vulnerabilities in cancer from genomic profiles.
Bioinformatics
; 30(14): 2051-9, 2014 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24665131
16.
Integrating biological pathways and genomic profiles with ChiBE 2.
BMC Genomics
; 15: 642, 2014 Aug 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25086704
17.
Using biological pathway data with paxtools.
PLoS Comput Biol
; 9(9): e1003194, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24068901
18.
Predicting transcription factor activity using prior biological information.
iScience
; 27(3): 109124, 2024 Mar 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38455978
19.
Pathway Commons, a web resource for biological pathway data.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D685-90, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21071392
20.
A prognostic matrix code defines functional glioblastoma phenotypes and niches.
bioRxiv
; 2023 Jun 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37333072